More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0636 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 308 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  99.68 
 
 		 308 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  89.61 
 
 		 315 aa  596  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  67.24 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  34.48 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  34.84 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  32.01 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  36.06 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  34.04 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  31.6 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  28.33 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  31.65 
 
 		 367 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.82 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  30.88 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  31.43 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  29.29 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  31.51 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  30.52 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  30.84 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  29.47 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  28.57 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  32.43 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  28.57 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  32.44 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  29.6 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  32 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  32 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  36.75 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.94 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  28.62 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  28.51 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  32.44 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.97 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  28.62 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  28.24 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  26.85 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  31.28 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  27.05 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  28.24 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  28.77 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.1 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  27.78 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  31.43 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  32.16 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  28.68 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  28.37 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.05 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  27.91 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  32.53 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  34.81 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  29.2 
 
 		 386 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  26.02 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  31.79 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  30.7 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.46 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  30.19 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.27 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.76 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  31 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.93 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  30.19 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  30.17 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  28.57 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.61 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  26.92 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  36.71 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  34.75 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  30.72 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  26.54 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.49 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  28.46 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.96 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  26.38 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  24.62 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  29.44 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  27.14 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.36 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.72 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.34 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0060  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1842  integrase family protein  27.63 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00549349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  28.1 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.89 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>