More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0092 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  69.27 
 
 		 405 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  52.84 
 
 		 345 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  50.28 
 
 		 335 aa  184  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  50.27 
 
 		 338 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  54.6 
 
 		 332 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  50.87 
 
 		 341 aa  177  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  50.87 
 
 		 341 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  49.14 
 
 		 336 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  51.15 
 
 		 333 aa  174  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  51.7 
 
 		 394 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  46.93 
 
 		 335 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  47.85 
 
 		 350 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  47.19 
 
 		 336 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  49.44 
 
 		 339 aa  171  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  49.15 
 
 		 314 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  49.15 
 
 		 338 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  47.8 
 
 		 343 aa  168  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  48.86 
 
 		 335 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  46.93 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  47.09 
 
 		 352 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  51.15 
 
 		 371 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  48.86 
 
 		 318 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  45.93 
 
 		 334 aa  161  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  44.62 
 
 		 313 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  44.63 
 
 		 343 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  40.91 
 
 		 336 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  41.38 
 
 		 327 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  40.91 
 
 		 331 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  42.69 
 
 		 326 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  57.02 
 
 		 121 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  43.43 
 
 		 337 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  41.34 
 
 		 345 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  42.69 
 
 		 326 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  42.05 
 
 		 375 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  40.22 
 
 		 347 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  56.41 
 
 		 126 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  57.14 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  34.76 
 
 		 337 aa  89  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  35.06 
 
 		 367 aa  84.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  36.09 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  36.88 
 
 		 343 aa  71.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  34.52 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  34.75 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  34.75 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  34.53 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  29.27 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.13 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  28.33 
 
 		 368 aa  64.7  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.95 
 
 		 351 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  31.19 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.36 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  33.33 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  31.82 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  30.62 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  34.03 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  34.81 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.77 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  31.47 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  32.46 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  27.16 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.54 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.03 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  32.03 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  32.03 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2383  integrase family protein  30.77 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000443336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.64 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  28.64 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.14 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  31.45 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  33.79 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  29.47 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.03 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.41 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.47 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  29.41 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.59 
 
 		 407 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.47 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.43 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.43 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  32 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  30.67 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  32.64 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  33.8 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.73 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  31.76 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  30.3 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  32.67 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  31.25 
 
 		 370 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  27.38 
 
 		 291 aa  57.8  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>