More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1314 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  100 
 
 
121 aa  247  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  56.3 
 
 
335 aa  146  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  59.13 
 
 
336 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  56.41 
 
 
335 aa  143  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  59.65 
 
 
345 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  57.14 
 
 
314 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  57.14 
 
 
338 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  58.12 
 
 
343 aa  140  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  58.12 
 
 
350 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  58.26 
 
 
318 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  57.02 
 
 
191 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  54.55 
 
 
405 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  55.93 
 
 
339 aa  136  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  57.02 
 
 
341 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  56.9 
 
 
394 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  57.02 
 
 
341 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  56.9 
 
 
371 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  57.66 
 
 
352 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  57.02 
 
 
333 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  54.78 
 
 
313 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  54.7 
 
 
336 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  55.08 
 
 
343 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  56.52 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  58.04 
 
 
258 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  49.17 
 
 
331 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  51.28 
 
 
338 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  49.12 
 
 
327 aa  120  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  51.69 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  47.86 
 
 
334 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  49.12 
 
 
347 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  49.09 
 
 
326 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  54.74 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  47.86 
 
 
375 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  53.98 
 
 
126 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  46.49 
 
 
336 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  47.32 
 
 
345 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  47.27 
 
 
326 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  46.09 
 
 
337 aa  105  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  37.7 
 
 
367 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  38.39 
 
 
337 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.86 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  33.61 
 
 
451 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  35.4 
 
 
392 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  33.02 
 
 
421 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  31.36 
 
 
354 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  31.36 
 
 
354 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.04 
 
 
322 aa  61.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.54 
 
 
325 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  37.5 
 
 
429 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  34.23 
 
 
337 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  34.4 
 
 
172 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  55.32 
 
 
99 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 
324 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  33.33 
 
 
275 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  33.05 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.71 
 
 
402 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 
310 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  38.1 
 
 
404 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  55.56 
 
 
407 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.9 
 
 
307 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.21 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  48.21 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  32.35 
 
 
308 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  30.88 
 
 
318 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  30.33 
 
 
317 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.74 
 
 
313 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  47.54 
 
 
306 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  47.83 
 
 
316 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 
308 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  46.43 
 
 
308 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  33.03 
 
 
347 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  46.43 
 
 
351 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  36.7 
 
 
342 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  50 
 
 
332 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0533  tyrosine recombinase XerD  46.43 
 
 
347 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  31.97 
 
 
321 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 
317 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  35.4 
 
 
294 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  35.92 
 
 
412 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  31.01 
 
 
314 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  42.11 
 
 
452 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  31.3 
 
 
401 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.09 
 
 
324 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  32.71 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.4 
 
 
310 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  48.94 
 
 
456 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  36.21 
 
 
338 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  33.05 
 
 
275 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  33.91 
 
 
294 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  48.94 
 
 
451 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  33.63 
 
 
317 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  35.29 
 
 
451 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  48.94 
 
 
451 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  36.25 
 
 
319 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0930  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.14 
 
 
385 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  37.93 
 
 
304 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  43.48 
 
 
328 aa  55.1  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.14 
 
 
300 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  47.83 
 
 
307 aa  54.7  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.63 
 
 
334 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>