More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3056 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  100 
 
 		 164 aa  344  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  72.63 
 
 		 341 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  71.58 
 
 		 341 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  67.37 
 
 		 336 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  63.16 
 
 		 335 aa  133  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  62.77 
 
 		 336 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  64.52 
 
 		 333 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  66.28 
 
 		 345 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  62.92 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  43.68 
 
 		 343 aa  128  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  60.87 
 
 		 334 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  66.67 
 
 		 338 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  59.34 
 
 		 352 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  63.75 
 
 		 313 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  62.22 
 
 		 332 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  54.74 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  55.17 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  58.54 
 
 		 314 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  58.54 
 
 		 350 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  58.54 
 
 		 338 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  58.54 
 
 		 343 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  57.32 
 
 		 339 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  57.14 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  56.96 
 
 		 335 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  59.26 
 
 		 258 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  56.25 
 
 		 371 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  59.26 
 
 		 327 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  55.56 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  48.28 
 
 		 331 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  52.5 
 
 		 394 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  47.87 
 
 		 336 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  52.44 
 
 		 405 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  53.57 
 
 		 326 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  56.96 
 
 		 326 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  51.61 
 
 		 347 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  53.68 
 
 		 345 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  54.22 
 
 		 337 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  60.87 
 
 		 375 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  45.07 
 
 		 337 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  37.18 
 
 		 367 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  29.03 
 
 		 309 aa  60.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 		 317 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  38.55 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.74 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  40.45 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  32.99 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  38.55 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  41.67 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.76 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  42.86 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 319 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.51 
 
 		 332 aa  57.4  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  40.51 
 
 		 330 aa  57.4  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 451 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  44.44 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_004310  BR2031  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  35 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  42.03 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  31.78 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1953  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  46 
 
 		 429 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  36.9 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.25 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  44.64 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 313 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  47.92 
 
 		 421 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  39.19 
 
 		 328 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.71 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  39.19 
 
 		 328 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 305 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 339 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  44.64 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  37.97 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  40 
 
 		 332 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  40.32 
 
 		 311 aa  54.3  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  40 
 
 		 332 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  37.8 
 
 		 333 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  48 
 
 		 322 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  32.17 
 
 		 317 aa  53.9  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0296  tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 351 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  39.58 
 
 		 328 aa  53.9  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  33.67 
 
 		 412 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  33.01 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  36.92 
 
 		 452 aa  53.9  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  39.34 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  35.9 
 
 		 354 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 408 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  36.73 
 
 		 381 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  49.15 
 
 		 329 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  47.73 
 
 		 314 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  47.73 
 
 		 294 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  35.9 
 
 		 354 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  36.73 
 
 		 381 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  33.62 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  30.77 
 
 		 309 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  34.83 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  36.73 
 
 		 381 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>