More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5552 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5552  phage integrase family protein  100 
 
 		 360 aa  740    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0894209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3445  integrase family protein  63.97 
 
 		 358 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6372  integrase family protein  64.25 
 
 		 358 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2540  integrase family protein  62.32 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2735  integrase family protein  62.32 
 
 		 355 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4274  phage integrase family protein  46.85 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4218  phage integrase family protein  46.55 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  45.66 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0582  phage integrase family protein  32.56 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0474  phage integrase family protein  32.56 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5943  phage integrase family protein  32.56 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.93 
 
 		 299 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 		 297 aa  90.1  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 299 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 299 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.38 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.3 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  32.9 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.73 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.25 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.12 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  34.21 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.76 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  31.69 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06640  site-specific recombinase XerD  24.71 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.74 
 
 		 313 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  29.19 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.26 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.57 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  32.79 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.7 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  31.77 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  28.43 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  25.24 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.21 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  28.1 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.19 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.77 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  24.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.85 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.55 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.25 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2641  integrase family protein  30.92 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  31.38 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  28.57 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  31.46 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  29.39 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.19 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  27.84 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  28.9 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  31.19 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.52 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  31.05 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.41 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  24.84 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  30.37 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.77 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  24.11 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.88 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  24.59 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.13 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.83 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  26.43 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  29.61 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.15 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>