More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2932 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  100 
 
 		 318 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  47.98 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  44.38 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  44.06 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  45.21 
 
 		 338 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  44.31 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  44.91 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  44.31 
 
 		 336 aa  289  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  43.71 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  45.65 
 
 		 375 aa  289  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  43.75 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  44.91 
 
 		 336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  44.16 
 
 		 345 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  42.72 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  43.61 
 
 		 337 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  46.43 
 
 		 314 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  43.53 
 
 		 343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  42.22 
 
 		 341 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  42.6 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  41.92 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  42.6 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  43.77 
 
 		 334 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  42.14 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  39.7 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  38.9 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  40.43 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  40.18 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  42.91 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  43.12 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  37.57 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  37.32 
 
 		 345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  38.76 
 
 		 347 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  38.11 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  44.26 
 
 		 258 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  48.86 
 
 		 191 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  58.26 
 
 		 121 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  56.76 
 
 		 126 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  55.17 
 
 		 164 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  38.15 
 
 		 172 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.08 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  32.72 
 
 		 367 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  31.82 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  32.43 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  26.67 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.55 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.45 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.61 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  34.81 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  30.89 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.33 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  34.81 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  34.81 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.69 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.69 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  32.1 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.33 
 
 		 353 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  33.77 
 
 		 172 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  25.9 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  25.9 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.63 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.35 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.4 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.22 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  31.86 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  30.26 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  29.55 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.64 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.85 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  34.71 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  31.65 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  28.5 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  26.76 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  28.06 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  27.31 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  25.33 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  26.25 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  27.23 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  26.92 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  28.02 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  27.04 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  25.4 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  25.51 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  28.11 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  32.73 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  24.09 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.91 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  32.7 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  27.37 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>