More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3066 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  100 
 
 		 337 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  53.78 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  53.07 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  52.47 
 
 		 327 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  51.53 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  51.84 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  44.79 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  43.61 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  41.02 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  39.1 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  37.64 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  38.24 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  37.61 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  36.72 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  40.18 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  37.1 
 
 		 394 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  37.8 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  38.44 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  37.35 
 
 		 352 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  37.8 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  35.33 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  35.33 
 
 		 350 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  35.33 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  39 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  35.29 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  34.94 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  36.15 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  34.24 
 
 		 405 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  36.56 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  34.84 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  34.6 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  37.58 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  34.65 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  40.17 
 
 		 258 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  43.43 
 
 		 191 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  46.09 
 
 		 121 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  41.96 
 
 		 126 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  28.33 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  54.22 
 
 		 164 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  30.17 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  30.17 
 
 		 354 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  28.33 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  32.96 
 
 		 172 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  29.21 
 
 		 343 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  28.85 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  26.49 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.21 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  23.91 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  30 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  29.85 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.85 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.39 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  28.69 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.42 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.1 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.97 
 
 		 251 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.51 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1439  integrase family protein  28.57 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.110569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.49 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  26.97 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.22 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  24.41 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.68 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  25.16 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  24.05 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  24.05 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  28.97 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  27.72 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  33.18 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  33.18 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  26.29 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.83 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  23.38 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  28.29 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  25.44 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.19 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  29.28 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  25.94 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  28.41 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  25.94 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.36 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  24.62 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  31.82 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.14 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>