More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1008 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  100 
 
 		 347 aa  728    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1079  integrase  47.95 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  50.15 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  49.85 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  44.99 
 
 		 350 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  45.88 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  45.59 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1340  phage integrase family protein  45 
 
 		 339 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  45.35 
 
 		 352 aa  298  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  46.15 
 
 		 336 aa  295  7e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  44.38 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  43.59 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  45.05 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0882  integrase family protein  44.09 
 
 		 313 aa  265  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  41.57 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  42.24 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05002  integrase  39.31 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  42.01 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  37.87 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  39.23 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  38.35 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4307  phage integrase family site specific recombinase  37.87 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0756066  hitchhiker  0.00146275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  39.64 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  38.76 
 
 		 318 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0269  integrase family protein  36.52 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0716  integrase  36.89 
 
 		 394 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  38.53 
 
 		 375 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  36.95 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0900  phage integrase family site specific recombinase  37.91 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  36.26 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  37.1 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  37.69 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  34.6 
 
 		 337 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53570  putative integrase  36.61 
 
 		 258 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000326616  decreased coverage  0.0000890956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0092  Fels-2 prophage protein  40.22 
 
 		 191 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000678287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1313  putative integrase  40.11 
 
 		 172 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0718359  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1314  phage integrase  49.12 
 
 		 121 aa  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188949  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  30.81 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3056  integrase family protein  51.61 
 
 		 164 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0372474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63440  bacteriophage integrase  41.59 
 
 		 126 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.38 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.26 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  30.77 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.74 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.11 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  30 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  30 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  24.79 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.14 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  21.56 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  35.66 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  28.57 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0323  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.158931  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  28.32 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  29.41 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  28.65 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  28.65 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  27.27 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.15 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  26.73 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.45 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.06 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  27.81 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.24 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  27.43 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.52 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  29.52 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  25.73 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.18 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.18 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  29.52 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.76 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.22 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.23 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  27.45 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  26.15 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.67 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>