More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0636 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  100 
 
 		 397 aa  822    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  42.91 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  41.11 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  40.98 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  33.88 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  35.02 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  47.37 
 
 		 189 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  37.25 
 
 		 388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  29.97 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  35.66 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.46 
 
 		 411 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0525  hypothetical protein  38.89 
 
 		 163 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677052  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  29.36 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.43 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  34.3 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  29.73 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.5 
 
 		 404 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.32 
 
 		 368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.17 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  31.08 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  34.15 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  32.51 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28.34 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  30.3 
 
 		 340 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.78 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  27.98 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.14 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.04 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  27.73 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  32.52 
 
 		 222 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.17 
 
 		 251 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  30.14 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.45 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  28.93 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.63 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  28.46 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  41.1 
 
 		 188 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30 
 
 		 330 aa  97.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  28.75 
 
 		 437 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  28.11 
 
 		 387 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.92 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.92 
 
 		 354 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  28.36 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  28.08 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  31.15 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  32.84 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.79 
 
 		 467 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.13 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 347 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  32.71 
 
 		 334 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  27.58 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  26.65 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  30.89 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.82 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.16 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.51 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  31.25 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  27.27 
 
 		 375 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  28.9 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  29.24 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.83 
 
 		 399 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  31.34 
 
 		 327 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.14 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  24.92 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.24 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.2 
 
 		 378 aa  89.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  25.67 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  27.62 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.59 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5040  prophage CP-933T integrase  31.38 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.530892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  26.77 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  24.67 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.6 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  38.31 
 
 		 159 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  26.05 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  27.06 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.21 
 
 		 300 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  27.06 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  32.8 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  26.67 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.67 
 
 		 401 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  32.68 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.67 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 381 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.49 
 
 		 477 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  29.96 
 
 		 310 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.21 
 
 		 284 aa  86.3  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>