More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2499 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  100 
 
 		 381 aa  780    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  60 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  46.63 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  45.38 
 
 		 398 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  38.64 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  42.91 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  40.28 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  34.67 
 
 		 388 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  42.07 
 
 		 189 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  33.81 
 
 		 400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.5 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.44 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.84 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  43.66 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  24.13 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  34.1 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  32.21 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.3 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.57 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  39.22 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  27.55 
 
 		 463 aa  92.8  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  26.34 
 
 		 409 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.35 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  28.96 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.03 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  31.8 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.27 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  30.67 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.34 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.59 
 
 		 451 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  34.25 
 
 		 353 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.56 
 
 		 393 aa  86.3  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  33.17 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.28 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  30.15 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  30.15 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.62 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  27.78 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25.51 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  29.89 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  36.36 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.46 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.46 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  37.14 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  33.79 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  28 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  25.58 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  38.69 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.62 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.61 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  26.48 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  34.84 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  27.93 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  36.36 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  29.06 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  30.96 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  29.36 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.84 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  31.39 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  32.88 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.47 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  33.86 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.8 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  28.41 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  28.41 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  30.49 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  29.3 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  28.99 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.88 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  29.62 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  28.68 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.57 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  27.37 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  32.95 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.27 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  30.6 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  30.31 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  28.93 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  30.27 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  30.27 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.54 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.2 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.57 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  30.27 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>