More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0241 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0241  Phage integrase  100 
 
 		 377 aa  770    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0930  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.85 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  24.8 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  27 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.26 
 
 		 411 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.41 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.31 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  21.62 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.09 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.41 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.41 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  24.23 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.15 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  19.89 
 
 		 444 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2865  site-specific recombinase XerD-like  21.22 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.11888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.51 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  22.98 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  23.42 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  28.45 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.28 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  21.61 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  25.56 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  24.58 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.5 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  22.82 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  22.11 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.29 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  20 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  30.24 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.87 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  24.79 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.05 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  29.06 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  23.1 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.52 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  22.99 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.81 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  25.45 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.23 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  21.39 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  22.84 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  26.52 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  26.83 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0909  phage integrase family site specific recombinase  25.52 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046478  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00832  hypothetical protein  25.52 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0428035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  26.5 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  24.92 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00815  integrase for prophage  24.37 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0720843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  31.29 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2795  integrase family protein  24.37 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0861235  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1225  phage integrase family protein  29.67 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  23.61 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  19.57 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  26.34 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  22.63 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  42.42 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  42.42 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  42.42 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.02 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2951  phage integrase  25 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.339524  hitchhiker  3.4545800000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  24.05 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 172 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  28.4 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  24.03 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  30.67 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.51 
 
 		 396 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  24.3 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  30.46 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  24.81 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  27.73 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  23.43 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.47 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  23.4 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1484  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.269781  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 		 223 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  30.06 
 
 		 159 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  21.2 
 
 		 430 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>