More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0497 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  78.61 
 
 		 400 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  87.53 
 
 		 400 aa  730    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  86.03 
 
 		 401 aa  722    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  100 
 
 		 412 aa  855    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  89.05 
 
 		 415 aa  750    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  78.89 
 
 		 399 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  80.51 
 
 		 400 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  78.61 
 
 		 400 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  77.44 
 
 		 399 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  89.05 
 
 		 415 aa  750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  89.47 
 
 		 399 aa  732    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  89.22 
 
 		 399 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  80.9 
 
 		 399 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  69.47 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  67.92 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  67.92 
 
 		 401 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  65.38 
 
 		 467 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  63.57 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  40.93 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  38.4 
 
 		 397 aa  249  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  65.19 
 
 		 181 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  39.38 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  38.86 
 
 		 384 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  88.62 
 
 		 143 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.55 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.79 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  27.7 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  30.56 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25.86 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  28.29 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  27.91 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  27.34 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.95 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.78 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  28.74 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.97 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.97 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.65 
 
 		 387 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.51 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.88 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.31 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.64 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 422 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.65 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.65 
 
 		 451 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.31 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  26.12 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.8 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.3 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  24.57 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  24.19 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  30.93 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  25.12 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  28.28 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  23.4 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25.54 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.62 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  42.99 
 
 		 137 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.24 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.62 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  24.51 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  24.53 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  22.57 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.2 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.91 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.73 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.13 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  25.36 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  31.44 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  23.86 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  23.31 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.6 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  21.99 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  25.8 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  20.63 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  25.28 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.34 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.91 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  25.95 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  26.38 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  23.58 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 395 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>