More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0919 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  100 
 
 
448 aa  921    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  39.42 
 
 
412 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  34.4 
 
 
387 aa  266  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.21 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.9 
 
 
388 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  27.63 
 
 
443 aa  136  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  29.64 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.35 
 
 
406 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  23.63 
 
 
476 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.59 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.27 
 
 
463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.65 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  30.13 
 
 
389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  25.18 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.37 
 
 
402 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.18 
 
 
414 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.9 
 
 
400 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.35 
 
 
397 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  26.6 
 
 
450 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.94 
 
 
411 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  25.06 
 
 
384 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.95 
 
 
467 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  27.8 
 
 
284 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  23.18 
 
 
486 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  25.46 
 
 
423 aa  94  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  24.55 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  27.05 
 
 
425 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  25 
 
 
424 aa  90.9  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.25 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  27.43 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  23.09 
 
 
423 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  27.24 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  27.8 
 
 
396 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  27.18 
 
 
440 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.15 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.61 
 
 
361 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  29.41 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.86 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  27.24 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  22.09 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  23.95 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  26.3 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.37 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  24.89 
 
 
500 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.76 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  24.82 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.21 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  23.71 
 
 
451 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  24.01 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.53 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.69 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  27.56 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  28.18 
 
 
412 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  28.12 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  24.76 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  25.76 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.71 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  24.76 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  27.69 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  26.33 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  28.42 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  25.51 
 
 
398 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  22.79 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  26.32 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  27.16 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  27.85 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.78 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  27.88 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  23.61 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  23.78 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.12 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  27.85 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  24.74 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  27.21 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  22.34 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  22.34 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.78 
 
 
409 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  23.86 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.83 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.45 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.21 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  23.54 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  27.81 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  27.66 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  26.07 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  30.36 
 
 
409 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.86 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  24.21 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  28.17 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  24.21 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  24.21 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.19 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.4 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.44 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  23.72 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.74 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  25.5 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  27.93 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  28.42 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  22.53 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>