More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0922 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  100 
 
 		 403 aa  841    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  57.14 
 
 		 411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  56.7 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  55.76 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  54.55 
 
 		 438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  52.16 
 
 		 400 aa  431  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  50.86 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  49.4 
 
 		 436 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  52.12 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  51.37 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  51.54 
 
 		 459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  51.52 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  50 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  51.62 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  52.82 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  49.14 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  48.21 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  48.25 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  50 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  47.73 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  45.76 
 
 		 398 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  48.09 
 
 		 401 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  46.97 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  49.62 
 
 		 391 aa  342  7e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  46.8 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  46.41 
 
 		 412 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  43.41 
 
 		 429 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  43.65 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  44.61 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  45.2 
 
 		 406 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  44.94 
 
 		 408 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  44.11 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  44.36 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  41.87 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  47.09 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  47.09 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  43.06 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  48.02 
 
 		 343 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  51.27 
 
 		 279 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  42.75 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  40.71 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  36.01 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  52.61 
 
 		 228 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  35.26 
 
 		 400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  33.86 
 
 		 408 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  35.26 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  31.79 
 
 		 384 aa  196  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  33.83 
 
 		 401 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.65 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  34.77 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.67 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  32.58 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 414 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  33.94 
 
 		 413 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.89 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  31.43 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  31.93 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  32.75 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  30.77 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.3 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  32.27 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  32.27 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.11 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  31.63 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  32.04 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  31.77 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.99 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  32.84 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  32.68 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  29.7 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  30.98 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  31.25 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  30.98 
 
 		 401 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  30.07 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  30.07 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  31.88 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  30.38 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  30.13 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  31.66 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  32.46 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  29.07 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  31.13 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  29.01 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  29.58 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  29.01 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  31.39 
 
 		 421 aa  156  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 408 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  31.36 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  30.77 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  30.98 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  30.13 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  30.28 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  30.28 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  31.66 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>