268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1326 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  100 
 
 		 457 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  100 
 
 		 457 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  67.61 
 
 		 479 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  65.32 
 
 		 449 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  62.17 
 
 		 472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  51.23 
 
 		 441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  47.26 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  43.83 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  38.96 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  42.89 
 
 		 450 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.39 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.27 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.98 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  29.46 
 
 		 486 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25.24 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  27.23 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 389 aa  96.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.28 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  25.78 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.02 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  22.34 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.2 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  24.94 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  22.86 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.45 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.19 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  26.79 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.4 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  24.15 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  24.41 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.06 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.82 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  24 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.04 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  24.77 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  28.03 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  23.72 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.6 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  22.54 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  27.04 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  23.8 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  21.78 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  23.21 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  22.71 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  22.94 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.02 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  23.42 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  26.67 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  22.86 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.6 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  24.2 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  22.72 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  21.16 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.7 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  23.72 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.43 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.73 
 
 		 431 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.51 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  23.06 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.1 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  20.13 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3737  hypothetical protein  45.33 
 
 		 150 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  25.94 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  23.16 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.08 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  30.87 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  22.6 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.06 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.26 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  24.87 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  22.75 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  23.41 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  24.57 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  36.36 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.54 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  31.27 
 
 		 377 aa  53.9  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  23.47 
 
 		 375 aa  53.5  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  26.59 
 
 		 442 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0432  integrase family protein  25.27 
 
 		 392 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  21.83 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  33.33 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  29.7 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  27.71 
 
 		 172 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  20 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  24.53 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.57 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  37.35 
 
 		 159 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  37.5 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  0.00000395125 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23.65 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  22.93 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>