More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1170 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  100 
 
 
412 aa  824    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  36.78 
 
 
426 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  37.62 
 
 
413 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  36.6 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  37.5 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  36.01 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  33.76 
 
 
413 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  30 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  35.42 
 
 
400 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  31.69 
 
 
417 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  37.45 
 
 
434 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  31.54 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  29.71 
 
 
423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  29.71 
 
 
450 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  30.31 
 
 
389 aa  146  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.89 
 
 
413 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  28.3 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  29.37 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.12 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  27.16 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.88 
 
 
433 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.79 
 
 
406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.72 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  30.05 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  26.85 
 
 
414 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  29.79 
 
 
414 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  29.79 
 
 
409 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.6 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  29.26 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  31.89 
 
 
387 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.85 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  29.97 
 
 
410 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  28.28 
 
 
439 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.96 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  26.74 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.26 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  25.06 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  28.07 
 
 
422 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  26.82 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.1 
 
 
398 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.06 
 
 
388 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.78 
 
 
439 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  27.37 
 
 
420 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 
395 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 
422 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.33 
 
 
412 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  27.76 
 
 
400 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.37 
 
 
402 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.76 
 
 
432 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.54 
 
 
410 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  27.55 
 
 
404 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.81 
 
 
399 aa  106  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  27.42 
 
 
419 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  24.03 
 
 
409 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  23.19 
 
 
422 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.15 
 
 
397 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.4 
 
 
402 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.23 
 
 
418 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  26.83 
 
 
414 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  26.3 
 
 
417 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.45 
 
 
379 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  24.12 
 
 
407 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.25 
 
 
400 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.29 
 
 
361 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  26.92 
 
 
395 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  26.9 
 
 
409 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  28.04 
 
 
411 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.15 
 
 
401 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.38 
 
 
396 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  26.18 
 
 
404 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  28.5 
 
 
419 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  28.17 
 
 
443 aa  100  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.37 
 
 
400 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  27.79 
 
 
451 aa  99.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.8 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.03 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.81 
 
 
437 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  23.36 
 
 
401 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  26.93 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  24.03 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.37 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  22.48 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.26 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  28.38 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  26.25 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  28.34 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.16 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.13 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  23.65 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  23.87 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.78 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.33 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3579  integrase  25.59 
 
 
389 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000745226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  28.01 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.34 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  26.03 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.26 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24.22 
 
 
416 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  27.37 
 
 
400 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  25.38 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>