More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1997 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  100 
 
 		 400 aa  813    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  61.2 
 
 		 390 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  55 
 
 		 438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  52.16 
 
 		 403 aa  431  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  51.8 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  52.96 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  51.11 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  52.08 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  51.69 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  50.39 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  51.02 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  50.13 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  49.5 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  45.34 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  51.08 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  48.48 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  49.1 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  60.14 
 
 		 279 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  48.45 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  45.96 
 
 		 415 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  51.67 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  46.43 
 
 		 398 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  47.31 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  51.67 
 
 		 359 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  50.96 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  48.14 
 
 		 391 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  44.95 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  44.69 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  47.94 
 
 		 408 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  47.33 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  46.43 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  46.53 
 
 		 412 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  42.97 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  46.92 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  48.58 
 
 		 407 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  40.99 
 
 		 434 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  48.31 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  46.41 
 
 		 420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  42.61 
 
 		 450 aa  285  9e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  41.83 
 
 		 439 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  39.53 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  39.53 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  38.67 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  38.58 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  50.22 
 
 		 228 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  33.85 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  36.27 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  34.45 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  34.47 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  34.92 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  32.8 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  36.34 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  33.51 
 
 		 422 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  33.33 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.55 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  34.04 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  33.33 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  34.27 
 
 		 421 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  35.6 
 
 		 409 aa  166  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  34.77 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  34.13 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  33.68 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  35.2 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  31.71 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  36 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  35.54 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  32.29 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  32.82 
 
 		 410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  29.82 
 
 		 409 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  33.6 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  33.77 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  33.77 
 
 		 397 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  31.84 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  34.88 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  34.88 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  31.83 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  32.2 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  34.88 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.23 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  32.1 
 
 		 410 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  33.16 
 
 		 419 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  31.93 
 
 		 411 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  33.16 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  32.63 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  34.29 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  32.21 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  32.02 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  32.03 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  32.29 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  32.29 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  33.6 
 
 		 399 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  34.47 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  33.07 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  31.13 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.2 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  31.5 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>