More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1496 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  100 
 
 		 343 aa  710    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  49.24 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  48.62 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  48.31 
 
 		 400 aa  311  9e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  48.12 
 
 		 436 aa  308  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  50 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  44.83 
 
 		 419 aa  308  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  49.24 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  49.67 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  48.37 
 
 		 407 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  48.02 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  47.72 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  48.94 
 
 		 409 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  44.08 
 
 		 410 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  47.55 
 
 		 459 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  45.06 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  48.16 
 
 		 397 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  46.22 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  45.16 
 
 		 399 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  42.98 
 
 		 417 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  43.02 
 
 		 410 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  43.95 
 
 		 411 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  42.66 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  44.41 
 
 		 404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  43.84 
 
 		 429 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  43.29 
 
 		 398 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  43.54 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  46.01 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  43.27 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  40.68 
 
 		 434 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  44.65 
 
 		 415 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  43.24 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  41.16 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  40.91 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  40.9 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  41.69 
 
 		 408 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  41.07 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  41.54 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  39.13 
 
 		 450 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  49.51 
 
 		 279 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  50 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  35.18 
 
 		 439 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  35.6 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  36.42 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  35.82 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  32.02 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  31.71 
 
 		 384 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  30.92 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  34.28 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  33.92 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  30.21 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  29.79 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.21 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  29.45 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  28.85 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.48 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  30.4 
 
 		 418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  32.65 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  30.63 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.77 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.88 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3652  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  30.34 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  28.77 
 
 		 413 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  28.57 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  29.86 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  29.73 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0982  phage integrase  50 
 
 		 125 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1014  phage integrase  47.86 
 
 		 125 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.71 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0954  phage integrase  47.01 
 
 		 125 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  27.87 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  26.98 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  28.65 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  28.74 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 419 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  29.5 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  27.06 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1048  phage integrase  47.01 
 
 		 125 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  28.9 
 
 		 403 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  31.36 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  28.53 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  28.4 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  28.44 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  27.73 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  26.8 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  28.99 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  30.06 
 
 		 406 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  28.32 
 
 		 421 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  26.79 
 
 		 419 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  26.86 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  28.14 
 
 		 407 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  25.8 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  28.41 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  30.5 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>