More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2309 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  100 
 
 		 410 aa  832    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  49.51 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  48.21 
 
 		 403 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  49.62 
 
 		 411 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  50.13 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  48.88 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  47.77 
 
 		 411 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  46.94 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  48.11 
 
 		 397 aa  362  9e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  46.4 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  49.51 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  45.15 
 
 		 459 aa  344  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  46.78 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  46.02 
 
 		 410 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  46.31 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  46.42 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  46.45 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  42.69 
 
 		 432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  46.68 
 
 		 391 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  45.25 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  47.62 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  44.9 
 
 		 411 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  46.72 
 
 		 412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  46.43 
 
 		 397 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  42.93 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  45.55 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  43.91 
 
 		 411 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  49.1 
 
 		 391 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  46.6 
 
 		 408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  41.65 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  41.88 
 
 		 429 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  50.28 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  50.28 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  45.61 
 
 		 420 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  45.37 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  45.85 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  42.12 
 
 		 450 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  43.02 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  45.13 
 
 		 279 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  40.22 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  36.27 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  37.53 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  38.3 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  35.82 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  46.05 
 
 		 228 aa  193  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  33.66 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.77 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  34.04 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  34.85 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.8 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  35.32 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  34.42 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  35.11 
 
 		 429 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  32.22 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  32.29 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  34.06 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  33.51 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  32.05 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  32.05 
 
 		 404 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  32.6 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  33.66 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  33.58 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  33.1 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  32.66 
 
 		 418 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  32.66 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 409 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  32.67 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.46 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.98 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  31.33 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  33 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  31.33 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  31.11 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  31.28 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.47 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  33.5 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  31.23 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  31.89 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  31.88 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  32.65 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  30.36 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  33.17 
 
 		 423 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  31.03 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  32.46 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  33.68 
 
 		 395 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  31.54 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  34.15 
 
 		 417 aa  166  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  32.76 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  33.66 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  30.34 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.73 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  34.19 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  30.21 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.63 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>