More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3606 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  100 
 
 		 420 aa  835    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  95.71 
 
 		 420 aa  776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  63.54 
 
 		 408 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  65.98 
 
 		 407 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  55.97 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  56.27 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  56.96 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  49.63 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  46.02 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  47.84 
 
 		 399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  48.08 
 
 		 391 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  44.11 
 
 		 403 aa  340  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  47.46 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  53.52 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  53.52 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  46.29 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  46.92 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  44.1 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  44.44 
 
 		 411 aa  329  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  47.14 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  46.84 
 
 		 397 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  47.12 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  47.73 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  46.13 
 
 		 407 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  47.04 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  45.61 
 
 		 410 aa  312  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  44.92 
 
 		 410 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  45.97 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  44.08 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  45.04 
 
 		 411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  45.41 
 
 		 398 aa  302  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  42.5 
 
 		 417 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  39.29 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  46.28 
 
 		 409 aa  289  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  41.21 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  39.26 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  39.57 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  36.72 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  43.24 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  48.55 
 
 		 279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  37.23 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  40.05 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  34.18 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  36.75 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  38.19 
 
 		 402 aa  210  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  38.44 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  46.09 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  35.47 
 
 		 401 aa  186  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  36.15 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  32.16 
 
 		 396 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  34.48 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  32.07 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  29.92 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.5 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  31.55 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.92 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  34.32 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.42 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  32.9 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.99 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  29.44 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  33.41 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.77 
 
 		 413 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  31.42 
 
 		 367 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  32.33 
 
 		 411 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  33.5 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  31.76 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  30.67 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  29.44 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.3 
 
 		 406 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.17 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.68 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  33.16 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  32.17 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  33.42 
 
 		 399 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  32.76 
 
 		 404 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  29.46 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  30.13 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.1 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  31.36 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  33.16 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  32.81 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.87 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.87 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  31.59 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  32.37 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.82 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  32.57 
 
 		 412 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  33.01 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  31.47 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  32.02 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  32.01 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 403 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.5 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.05 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  33.25 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  30 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>