More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0966 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  100 
 
 		 410 aa  834    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  58.12 
 
 		 398 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  55.03 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  54.06 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  47.07 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  50.64 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  50.9 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  47.73 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  52.89 
 
 		 409 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  46.57 
 
 		 419 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  47.15 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  48.47 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  49.51 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  46.02 
 
 		 410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  48.16 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  46.96 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  46.04 
 
 		 411 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  47.33 
 
 		 400 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  45.85 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  47.54 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  48.62 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  45.02 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  48.35 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  46.87 
 
 		 412 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  46.46 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  46.11 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  43.28 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  39.76 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  45.32 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  43.99 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  42.42 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  44.47 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  43.29 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  46.08 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  44.08 
 
 		 343 aa  288  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  46 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  46 
 
 		 365 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  39.9 
 
 		 429 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  39.9 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  41.39 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  38.97 
 
 		 450 aa  259  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  41.58 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  36.91 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  44.53 
 
 		 279 aa  229  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  49.12 
 
 		 228 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  31.68 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  34.06 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  31.63 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  31.81 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  33.42 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  33.25 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  30.81 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  31.62 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  32.86 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  33.25 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.16 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  32.25 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  31.38 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  30.29 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  31.12 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  31.12 
 
 		 404 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  34.47 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  30.84 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  32.1 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  29.92 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  31.66 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  30.17 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  31.41 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  30.96 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  30.2 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  31.41 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  31.25 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  29.69 
 
 		 419 aa  150  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.76 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.37 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.85 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  32.05 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  30.98 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.99 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.25 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  29.95 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  30.38 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  31.93 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  28.31 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  29.89 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  30.39 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  30.45 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  30.81 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  29.06 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  30.18 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  31.68 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  29.76 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  31.68 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  29.24 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  30.21 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  29.95 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  30.21 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>