More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3231 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  100 
 
 
362 aa  732    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  88.57 
 
 
387 aa  547  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  59.68 
 
 
384 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  61.78 
 
 
401 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  35.63 
 
 
411 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  32.73 
 
 
402 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  32.01 
 
 
410 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  33.73 
 
 
410 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  32.33 
 
 
390 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  32.63 
 
 
400 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  34.69 
 
 
412 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  34.85 
 
 
415 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  33.33 
 
 
417 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  33.03 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  32.1 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  33.93 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  33.85 
 
 
403 aa  143  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  32.82 
 
 
411 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  33.03 
 
 
391 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  34.03 
 
 
411 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  32.83 
 
 
397 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  31.85 
 
 
404 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  35.24 
 
 
359 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  35.24 
 
 
365 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  34.04 
 
 
438 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  34.27 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  31.14 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  35.17 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  31.23 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  34.93 
 
 
420 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  31.3 
 
 
419 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  34.44 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  33.85 
 
 
391 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  33.84 
 
 
420 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  29.45 
 
 
343 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  33.43 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4223  CP4-like integrase  92.31 
 
 
65 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.11664  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  28.82 
 
 
434 aa  126  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  29.39 
 
 
403 aa  126  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  31.29 
 
 
414 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  33.7 
 
 
429 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  33.96 
 
 
429 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  30.89 
 
 
406 aa  124  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  31.91 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.31 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  30.28 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  29.01 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  27.81 
 
 
415 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  29.75 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  26.63 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  30.23 
 
 
436 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  29.57 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  31.65 
 
 
439 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  27.3 
 
 
410 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  31.31 
 
 
404 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  28.75 
 
 
416 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  29.54 
 
 
415 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  29.45 
 
 
413 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  27.38 
 
 
402 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  28.79 
 
 
408 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  27.91 
 
 
419 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  26.07 
 
 
398 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  27.47 
 
 
413 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  28.35 
 
 
409 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  29.66 
 
 
416 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  29.45 
 
 
416 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  30.45 
 
 
429 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  26.83 
 
 
413 aa  100  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  25.93 
 
 
411 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.02 
 
 
396 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  25.85 
 
 
418 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  29.79 
 
 
422 aa  96.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  28.22 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.21 
 
 
404 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  27.47 
 
 
403 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  25.91 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.66 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  31.8 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  30.92 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  26.59 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  33.88 
 
 
228 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  27.86 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  28.92 
 
 
397 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.13 
 
 
402 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  26.77 
 
 
418 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  28.35 
 
 
425 aa  92.8  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  29.09 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  24.54 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  24.54 
 
 
436 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  25.91 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  31.06 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  29.46 
 
 
421 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  28.96 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  24.54 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  29.01 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  27.96 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  26.39 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  28.84 
 
 
393 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  30.21 
 
 
404 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  30.21 
 
 
404 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>