131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4223 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4223  CP4-like integrase  100 
 
 		 65 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.11664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  92.31 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  81.54 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  63.08 
 
 		 384 aa  95.9  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  56.9 
 
 		 390 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  51.67 
 
 		 411 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  55.17 
 
 		 391 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  53.33 
 
 		 404 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  49.21 
 
 		 398 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  52.38 
 
 		 359 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  52.38 
 
 		 365 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  50 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  52.54 
 
 		 438 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  46.03 
 
 		 410 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  50 
 
 		 411 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  50 
 
 		 401 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  51.72 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  49.15 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  50 
 
 		 410 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  52.73 
 
 		 412 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  48.28 
 
 		 403 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  50 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  50.85 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  50 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  48.28 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  50 
 
 		 409 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  41.54 
 
 		 401 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  48.33 
 
 		 406 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  48.33 
 
 		 420 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  46.03 
 
 		 439 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  48.33 
 
 		 420 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  51.85 
 
 		 407 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  45 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  48.21 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  45.16 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  44.83 
 
 		 408 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  43.1 
 
 		 343 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  42.62 
 
 		 402 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  39.66 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  45.45 
 
 		 436 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  40.98 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  39.66 
 
 		 397 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  40.32 
 
 		 428 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  43.1 
 
 		 419 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  43.33 
 
 		 413 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3699  phage integrase  44.83 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  44.64 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  48.33 
 
 		 415 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  43.1 
 
 		 433 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  41.38 
 
 		 413 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  40.62 
 
 		 421 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  43.1 
 
 		 404 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  37.93 
 
 		 444 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  38.1 
 
 		 411 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  44.83 
 
 		 411 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  43.1 
 
 		 404 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  39.66 
 
 		 412 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  41.67 
 
 		 420 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  39.66 
 
 		 416 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  36.21 
 
 		 432 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  39.66 
 
 		 422 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  39.39 
 
 		 403 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  40.74 
 
 		 450 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  44.64 
 
 		 462 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  43.1 
 
 		 419 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1358  integrase, truncation  38.6 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.760246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  40.35 
 
 		 412 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  35.59 
 
 		 413 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  39.66 
 
 		 404 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  48.28 
 
 		 411 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  39.66 
 
 		 402 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  40.32 
 
 		 404 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 421 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  39.66 
 
 		 418 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  41.38 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  39.66 
 
 		 419 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  34.92 
 
 		 403 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  43.1 
 
 		 427 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  41.67 
 
 		 399 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  38.6 
 
 		 414 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  51.72 
 
 		 407 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  40.32 
 
 		 445 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3652  phage integrase family protein  41.07 
 
 		 387 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  39.66 
 
 		 400 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  39.66 
 
 		 402 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  37.93 
 
 		 413 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  39.66 
 
 		 409 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  35.59 
 
 		 408 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  42.11 
 
 		 395 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  41.07 
 
 		 410 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  40 
 
 		 411 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  34.48 
 
 		 414 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  36.21 
 
 		 415 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1605  phage integrase  33.33 
 
 		 448 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1418  phage integrase family site specific recombinase  34.43 
 
 		 391 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.239727  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  36.21 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.66 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  38.18 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  38.33 
 
 		 378 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1048  phage integrase  36.67 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>