More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1034 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  100 
 
 		 444 aa  932    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  36.3 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1605  phage integrase  34.81 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0886  phage integrase  34.32 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00972856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  35.47 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1189  phage integrase family protein  33.83 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  38.83 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  35.84 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  35.32 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  35.09 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  34.25 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  33.49 
 
 		 420 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  33.33 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.74 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  33.66 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  35.24 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  33.58 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  35.77 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  34.37 
 
 		 413 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  32.93 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  33 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  33.83 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  32.62 
 
 		 410 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  32.85 
 
 		 404 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  32 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  32.81 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  31.72 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  32.94 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  31.51 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  32.51 
 
 		 419 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  32.11 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  31.67 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  32.39 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  31.16 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 378 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  32.98 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  31.3 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  30.07 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  30.9 
 
 		 407 aa  166  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  33.57 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3377  phage integrase family protein  32.81 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  31.14 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  30.99 
 
 		 412 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  27.87 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  28.13 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  30.77 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  32.52 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  29.72 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  29.26 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.13 
 
 		 402 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  30.27 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  28.54 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  30.81 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  29.32 
 
 		 397 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.07 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.58 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  28.32 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  29.8 
 
 		 404 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  29.64 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  30.07 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  29.25 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  28.01 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  29.28 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  27.95 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  31.04 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  29.28 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  28.72 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  29.59 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2957  integrase family protein  28.87 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  29.1 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  26.33 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  28.86 
 
 		 402 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  27.61 
 
 		 418 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  27.83 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  31.76 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  28.4 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  29.26 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  27.76 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  28.22 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  28.83 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  29.35 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  28.61 
 
 		 404 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  28.35 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  28.35 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  29.18 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  30.65 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  29.77 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>