More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1605 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0886  phage integrase  90.85 
 
 		 454 aa  856    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00972856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1605  phage integrase  100 
 
 		 448 aa  931    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  34.81 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  35.84 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  37.16 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1189  phage integrase family protein  34.35 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.172941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  35.17 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  34.38 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  35.06 
 
 		 400 aa  216  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  33.57 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  33.66 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  35.45 
 
 		 419 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  34.52 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  35.99 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  32.14 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  34.29 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  33.65 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  33.25 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  31.71 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  34.05 
 
 		 410 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  37.92 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  32.51 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  32.12 
 
 		 404 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  33.5 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  33.95 
 
 		 378 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  33.85 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  33.09 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  32.04 
 
 		 411 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  34.93 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  33.42 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  32.9 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  32.4 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  32.4 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  33.01 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  32.85 
 
 		 403 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  31.75 
 
 		 407 aa  194  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  32.77 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  32.42 
 
 		 421 aa  190  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  32.87 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  33.33 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  31.34 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  30.09 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  32.02 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 404 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  29.51 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  30.5 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  30.66 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  30.88 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  29.98 
 
 		 425 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  30.48 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  30.62 
 
 		 404 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  30.31 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  30.5 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  31.64 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.52 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  27.49 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  30.85 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  29.37 
 
 		 422 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.5 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  28.9 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  28.57 
 
 		 416 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  28.27 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.4 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  33.06 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.36 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  27.36 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  27.36 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  28.82 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.29 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  30 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  30 
 
 		 409 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  30 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.88 
 
 		 420 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  28.74 
 
 		 416 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  29.64 
 
 		 421 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  28.57 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  27.62 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  27.89 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  30.83 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  29.1 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  29.22 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  26.93 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.59 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  29.84 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  29.81 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  28.33 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  31.51 
 
 		 399 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  29.76 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  29.82 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  29.13 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  29.9 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  28.57 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.57 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>