More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0847 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  100 
 
 
403 aa  827    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  42.86 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  42.71 
 
 
390 aa  279  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  40.35 
 
 
411 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  37.32 
 
 
419 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  39.31 
 
 
411 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  36.41 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  37.09 
 
 
438 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  36.25 
 
 
411 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  38.67 
 
 
400 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  36.99 
 
 
429 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  39.7 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  36.52 
 
 
429 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  36.27 
 
 
410 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  38.42 
 
 
399 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  36.01 
 
 
403 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  36.91 
 
 
410 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  36.98 
 
 
401 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  37.87 
 
 
407 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  35.75 
 
 
459 aa  223  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  35.47 
 
 
404 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  40.55 
 
 
391 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  35.82 
 
 
411 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  36.74 
 
 
436 aa  216  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  41.62 
 
 
359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  41.8 
 
 
365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  37.78 
 
 
397 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  37.89 
 
 
391 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  37.23 
 
 
420 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  36.98 
 
 
420 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  37.66 
 
 
409 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  36.23 
 
 
406 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  36.27 
 
 
408 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  35.1 
 
 
417 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  33.59 
 
 
432 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  34.3 
 
 
434 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  35.79 
 
 
398 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  37.28 
 
 
407 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  35.7 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  35.83 
 
 
400 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  35.6 
 
 
343 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  35.06 
 
 
384 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  33.67 
 
 
387 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  33.09 
 
 
439 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  34.45 
 
 
401 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  32.58 
 
 
408 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  29.57 
 
 
402 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  37.09 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  30.83 
 
 
396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  31.67 
 
 
396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.42 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.17 
 
 
394 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  31.74 
 
 
450 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  32.2 
 
 
413 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  31.94 
 
 
401 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  30.41 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  32.07 
 
 
408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  32.84 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  30.53 
 
 
394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.55 
 
 
402 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  30.77 
 
 
412 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30.39 
 
 
410 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  29.64 
 
 
387 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  29.85 
 
 
396 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.8 
 
 
404 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  32.27 
 
 
404 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  32.27 
 
 
404 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  27.83 
 
 
404 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  31.68 
 
 
422 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  27.83 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  32.02 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  30.37 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.09 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  31.97 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  33.01 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  27.38 
 
 
404 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  30.49 
 
 
404 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  30.97 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  32.19 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  30.81 
 
 
398 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  30.41 
 
 
404 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  31.25 
 
 
411 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  30.41 
 
 
404 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  33.85 
 
 
362 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  30.97 
 
 
401 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  30.56 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  31.25 
 
 
367 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  28.54 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  27.5 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  27.5 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  28.5 
 
 
419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  30.61 
 
 
407 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  30.9 
 
 
419 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  30.71 
 
 
397 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  30.82 
 
 
419 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  30.61 
 
 
429 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  31.71 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  29.5 
 
 
391 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  30 
 
 
395 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  28.19 
 
 
395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>