More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0275 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  100 
 
 		 407 aa  827    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  57.07 
 
 		 390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  54.39 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  52.97 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  52.91 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  51.62 
 
 		 403 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  51.27 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  50.88 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  48.2 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  52.05 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  49.11 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  47.1 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  49.87 
 
 		 415 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  48.15 
 
 		 404 aa  359  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  48.23 
 
 		 399 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  46.45 
 
 		 410 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  48.66 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  47.34 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  46.68 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  48.14 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  47.7 
 
 		 397 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  44.56 
 
 		 391 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  48.37 
 
 		 343 aa  318  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  43.19 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  46.13 
 
 		 420 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  43.22 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  46.13 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  45.45 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  48.24 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  44.71 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  43.03 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  41.9 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  43.54 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  42.46 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  43.78 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  51.8 
 
 		 279 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  46.37 
 
 		 359 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  46.37 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  40 
 
 		 434 aa  292  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  43.65 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  40.98 
 
 		 439 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  37.28 
 
 		 403 aa  236  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  35.25 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  36.88 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  36.62 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  47.19 
 
 		 228 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  34.9 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  34.97 
 
 		 387 aa  186  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.92 
 
 		 402 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  32.85 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  32.72 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  32.16 
 
 		 411 aa  167  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  32.75 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  31.84 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  31.14 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  33 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  31.83 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  32.58 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  30.33 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  32.11 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.65 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  32.53 
 
 		 411 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  32.29 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  30.69 
 
 		 415 aa  159  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  32.52 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  26.88 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  30.36 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  30.87 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  32.05 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  31.05 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.03 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  29.72 
 
 		 418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  30.75 
 
 		 421 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  31.62 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  31.75 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.94 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  32.18 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  32.17 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  30.79 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  34.44 
 
 		 362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  30.77 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  30.53 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  31.06 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  32.06 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 412 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  30.79 
 
 		 404 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  30.79 
 
 		 404 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  32.12 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  30.56 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  30.49 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  30.79 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2541  putative CP4-like integrase  29.35 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  31.41 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  30.05 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  30.73 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  29.9 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>