More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2203 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  100 
 
 		 404 aa  810    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  54.52 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  55.97 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  57.68 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  56.39 
 
 		 420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  51.73 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  53.9 
 
 		 408 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  51.37 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  54.29 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  48.25 
 
 		 403 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  47.98 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  49.23 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  47.13 
 
 		 397 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  47.98 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  47.57 
 
 		 436 aa  349  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  46.93 
 
 		 450 aa  348  8e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  56.23 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  56.79 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  48.15 
 
 		 407 aa  342  9e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  47.31 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  45.61 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  44.42 
 
 		 419 aa  330  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  47.62 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  49.49 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  47.03 
 
 		 415 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  44.05 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  45.96 
 
 		 397 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  42.5 
 
 		 417 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  45.59 
 
 		 411 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  43.28 
 
 		 410 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  41.81 
 
 		 429 aa  298  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  44.36 
 
 		 409 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  45.07 
 
 		 411 aa  295  7e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  41.33 
 
 		 429 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  40.92 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  39.13 
 
 		 434 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  42.28 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  41.56 
 
 		 406 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  44.41 
 
 		 343 aa  269  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  47.1 
 
 		 279 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  39.85 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  35.47 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  34.11 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  36.45 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  35.8 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  46.02 
 
 		 228 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  33.25 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  34.29 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  31.97 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  33.25 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  31.7 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  33.17 
 
 		 411 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  31.8 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  31.33 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  31.28 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  31.59 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  34.45 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  32.31 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  32.03 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 411 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  31.67 
 
 		 411 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  30.77 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  31.94 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  30.92 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  31.53 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  32.11 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  30.95 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  32.82 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  31.36 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.45 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  30.42 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  30.67 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  29.64 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  30.57 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  31.01 
 
 		 403 aa  136  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.5 
 
 		 401 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.86 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  30.25 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.83 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  32.4 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  30.95 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  31.85 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  30.71 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  30.89 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  30.37 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  32.35 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  32.22 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  29.88 
 
 		 421 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  31.36 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  28.68 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  29.65 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  30.9 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  28.43 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  32.9 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  28.43 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>