More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0239 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  100 
 
 
384 aa  779    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  59.74 
 
 
401 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  60.43 
 
 
387 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  59.68 
 
 
362 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  37.14 
 
 
412 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  38.58 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  34.59 
 
 
411 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  35.31 
 
 
390 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  37.91 
 
 
420 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  37.28 
 
 
415 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  36.75 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  38.44 
 
 
407 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  35.82 
 
 
410 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  31.79 
 
 
403 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  35.84 
 
 
417 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  34.55 
 
 
411 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  36.68 
 
 
436 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  34.54 
 
 
438 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  33.5 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  36.41 
 
 
408 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  33.42 
 
 
399 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  34.78 
 
 
411 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  33.59 
 
 
400 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  34.54 
 
 
402 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  36.48 
 
 
391 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  35.06 
 
 
403 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  34.74 
 
 
391 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  33.67 
 
 
411 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  33.33 
 
 
406 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  34.19 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  34.71 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  35.85 
 
 
359 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  35.85 
 
 
365 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  34.9 
 
 
407 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  30.2 
 
 
419 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  33.25 
 
 
404 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  32.22 
 
 
410 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  33.41 
 
 
429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  33.73 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  31.85 
 
 
434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  32.2 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  30.08 
 
 
432 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  31.59 
 
 
459 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  31.76 
 
 
397 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  31.41 
 
 
409 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  31.71 
 
 
343 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.71 
 
 
414 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.65 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  28.35 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  34.08 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  29.72 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  28.46 
 
 
408 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  29.43 
 
 
429 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  28.28 
 
 
402 aa  126  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.12 
 
 
396 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.95 
 
 
415 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  28.24 
 
 
413 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.7 
 
 
404 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  30.92 
 
 
421 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  30.75 
 
 
401 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  27.3 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  28.68 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  29.01 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  29.01 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  28.61 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  29.01 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  28.9 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  27.46 
 
 
421 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  29.77 
 
 
423 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  27.08 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  28.04 
 
 
416 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  29.55 
 
 
413 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  28.28 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  26.95 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  30.05 
 
 
445 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  27.11 
 
 
394 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  28.98 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  27.59 
 
 
415 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  29.07 
 
 
403 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  29.2 
 
 
419 aa  116  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  28.12 
 
 
422 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  28.18 
 
 
416 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.37 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  28.24 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  34.02 
 
 
228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  28.04 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  28.31 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  29.97 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  29 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  28.64 
 
 
450 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  29.77 
 
 
404 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  27.27 
 
 
415 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  27.73 
 
 
402 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.37 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  30.03 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  28.32 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  29.55 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  26.37 
 
 
404 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.46 
 
 
416 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>