More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0229 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  100 
 
 
401 aa  813    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  59.74 
 
 
384 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  59.42 
 
 
387 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  61.78 
 
 
362 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  35.56 
 
 
411 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  37.59 
 
 
415 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  35.4 
 
 
412 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  34.67 
 
 
411 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  33.83 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  34.04 
 
 
417 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  33.66 
 
 
410 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  34.47 
 
 
400 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  32.51 
 
 
401 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  34.8 
 
 
438 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  33.66 
 
 
411 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  30.9 
 
 
419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  35.96 
 
 
420 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  32.66 
 
 
411 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  31.59 
 
 
390 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  35.47 
 
 
420 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  33.42 
 
 
399 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  34.29 
 
 
404 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  34.45 
 
 
403 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  33.83 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  35.19 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  29.5 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  32.11 
 
 
398 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  32 
 
 
397 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  34.83 
 
 
436 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  32.51 
 
 
400 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  31.81 
 
 
410 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  32.51 
 
 
402 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  33.67 
 
 
391 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  32.4 
 
 
429 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  31.7 
 
 
429 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  31.14 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  33.5 
 
 
408 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  29.24 
 
 
432 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  31.34 
 
 
407 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  30.42 
 
 
397 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  32.99 
 
 
409 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  30.26 
 
 
406 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  34.44 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  34.45 
 
 
359 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  31.68 
 
 
439 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  30.92 
 
 
343 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  30.48 
 
 
413 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.99 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  29.95 
 
 
415 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  29.8 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.28 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  29.97 
 
 
397 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  30.23 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.37 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  30.3 
 
 
416 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  29.36 
 
 
415 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 
394 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  30.77 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  29.16 
 
 
419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  31.56 
 
 
409 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  28.53 
 
 
398 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  29.18 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  28.64 
 
 
404 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  29.41 
 
 
412 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  27.55 
 
 
410 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  28.68 
 
 
396 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.04 
 
 
404 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  34.1 
 
 
279 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  28.94 
 
 
389 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  28.79 
 
 
404 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  28.74 
 
 
409 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 
404 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  29.11 
 
 
404 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  29.11 
 
 
404 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  30.75 
 
 
391 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  30.73 
 
 
402 aa  123  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  28.1 
 
 
413 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  27.38 
 
 
425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  29.31 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  28.15 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  29.92 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  30.05 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  28.57 
 
 
404 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  29.52 
 
 
445 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  29.69 
 
 
404 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  27.82 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  25.94 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  27.9 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  27.14 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  30.39 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  30.07 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  25.81 
 
 
418 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  28.99 
 
 
410 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  27.78 
 
 
422 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  27.92 
 
 
402 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  27.8 
 
 
408 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  25.44 
 
 
418 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  28.87 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  27.88 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  28.5 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>