More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1116 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  100 
 
 		 434 aa  900    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  46.97 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  45.61 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  42.68 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  43.49 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  42.93 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  42.54 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  43.47 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  40.99 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  41.25 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  41.18 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  43.24 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  41.9 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  39.76 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  44.39 
 
 		 409 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  42.36 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  40.96 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  42.64 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  39.13 
 
 		 404 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  39.66 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  40 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  40.92 
 
 		 397 aa  273  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  38.74 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  36.92 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  39.95 
 
 		 408 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  38.14 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  38.01 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  38.84 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  41.61 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  39.39 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  40.68 
 
 		 343 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  37.64 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  39.12 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  36.72 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  39.01 
 
 		 365 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  39.01 
 
 		 359 aa  235  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  36.76 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  33.65 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  37.56 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  35.9 
 
 		 402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  34.41 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  34.3 
 
 		 403 aa  203  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  38.68 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  45.54 
 
 		 228 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  29.5 
 
 		 401 aa  170  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  31.85 
 
 		 384 aa  166  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  31.28 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.58 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  30.99 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  29.2 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  28.85 
 
 		 429 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  31.51 
 
 		 416 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  30.99 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  27.47 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  27.95 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  30.19 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  30.46 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  29.98 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.05 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0927  integrase family protein  27.06 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  30.39 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  30 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  30.39 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29.9 
 
 		 404 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  29.38 
 
 		 401 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  31.92 
 
 		 397 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  29.9 
 
 		 415 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  28.22 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  28.72 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  29.7 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  28.35 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  29.09 
 
 		 419 aa  136  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  27.85 
 
 		 404 aa  136  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.78 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  27.78 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  29.95 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  27.74 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  29.95 
 
 		 428 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  30.2 
 
 		 438 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  30.62 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  28.02 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  26.71 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  28.29 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  27.41 
 
 		 410 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  27.78 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  28 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  27.63 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.1 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  28.31 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>