More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1142 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  100 
 
 		 399 aa  815    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  55.86 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  56.44 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  51.73 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  51.52 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  57.34 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  52.3 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  56.23 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  51.81 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  51.01 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  49.75 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  49.01 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  48.88 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  49.64 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  48.48 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  47.06 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  47.06 
 
 		 459 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  48.63 
 
 		 408 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  46.04 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  45.85 
 
 		 410 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  48.23 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  48.09 
 
 		 420 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  48.44 
 
 		 412 aa  329  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  47.84 
 
 		 420 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  46.72 
 
 		 450 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  47.3 
 
 		 407 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  45.84 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  44.31 
 
 		 406 aa  319  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  49.08 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  45.64 
 
 		 415 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  44.86 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  46.68 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  44.53 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  42.46 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  42.23 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  43.04 
 
 		 411 aa  292  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  40.96 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  40.73 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  45.16 
 
 		 343 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  38.46 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  45.22 
 
 		 279 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  38.42 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  51.95 
 
 		 228 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  33.59 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  38.28 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  38.14 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  33.42 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  35.98 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  33.42 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  31.3 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.93 
 
 		 414 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  32.35 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  31.48 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.66 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  30.93 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  33.9 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  32.81 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  32.02 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  31.03 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  30.16 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  30.13 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  32.09 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  31.22 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  31.15 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.33 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  30.93 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.95 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  30.67 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  34.28 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  30.67 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  31.78 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  33.6 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  32.35 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  31.45 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  31.45 
 
 		 411 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  32.25 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  31.84 
 
 		 411 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  32.59 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  29.87 
 
 		 416 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.66 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  29.2 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  30.37 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  30.67 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.03 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  26.03 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  30.21 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  30.56 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  30.18 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  30.1 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.86 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  30.1 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  30.1 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  34.21 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  31.76 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  30.21 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>