More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2480 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  100 
 
 		 397 aa  809    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  53.44 
 
 		 411 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  51.28 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  50 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  53.26 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  52.05 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  49.1 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  50.99 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  50.13 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  48.65 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  46.08 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  45.69 
 
 		 417 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  47.57 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  46.48 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  49.62 
 
 		 408 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  71.11 
 
 		 228 aa  340  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  48.59 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  47.19 
 
 		 407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  51.02 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  49.07 
 
 		 409 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  45.96 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  46.43 
 
 		 410 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  46.68 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  43.78 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  49.62 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  43.5 
 
 		 429 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  47.73 
 
 		 420 aa  319  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  48.36 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  48.08 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  46.79 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  44.08 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  44.2 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  44.53 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  47.59 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  48.17 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  48.17 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  44.13 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  48.16 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  40.78 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  40.33 
 
 		 450 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  48.72 
 
 		 279 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  37.78 
 
 		 403 aa  223  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  39.75 
 
 		 439 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  37.76 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  38.02 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  34.12 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  32.49 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  31.76 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  30.42 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  32.41 
 
 		 438 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  32.99 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  34.18 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.83 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.35 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  34.04 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  32.73 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  34.13 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  32.04 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  30.58 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  30.95 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  32.45 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  30.75 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  31.52 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  32.49 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  32.19 
 
 		 396 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  31.48 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.75 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  30.61 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  32.35 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  30.75 
 
 		 419 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  32.67 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  30.49 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  28.86 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  30.9 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  31.93 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  30.77 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  31.4 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  31.46 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  31.46 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  30.69 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  32.99 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  30.75 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  32.55 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  29.37 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  31.37 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  33.96 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  31.5 
 
 		 407 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  30.23 
 
 		 424 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  32.49 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  30.13 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  30.02 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.41 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  31.3 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  30.53 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  31.73 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  31.73 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  30.87 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  30.73 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>