More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1546 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  100 
 
 		 387 aa  780    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  88.57 
 
 		 362 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  60.43 
 
 		 384 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  59.42 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  35.98 
 
 		 411 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  35.32 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  36.27 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  36.27 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  34.85 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  35.05 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  34.34 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  32.12 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  33.33 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  34.77 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  33.67 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  34.24 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  35.98 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  32.75 
 
 		 459 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  31.63 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  33.58 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  36.83 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  36.15 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  33.75 
 
 		 391 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  31.97 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  31.88 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  32.04 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  35.32 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  30.9 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  34.87 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  35.31 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  35.91 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  35.91 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  32.82 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  33.73 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  33.08 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  31.84 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  30.89 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  31.22 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  30.15 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.5 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  31.48 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  31.04 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  28.61 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  29.79 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  27.74 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  29.14 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  28.08 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  28.86 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  29.08 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  31.17 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.33 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  28.75 
 
 		 413 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  30.53 
 
 		 416 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  28.72 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  30.18 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  30.26 
 
 		 416 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  29.21 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  28.04 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  31.54 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  28.72 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  29.1 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  28.68 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  27.76 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4223  CP4-like integrase  81.54 
 
 		 65 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.11664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  31.16 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  27.37 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  28.05 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  28.75 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  28.06 
 
 		 643 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  27.09 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  27.25 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  27.25 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  27.91 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  30.16 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  29.81 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  28.39 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  27.47 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  27.46 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  32.33 
 
 		 279 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  28.39 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  28.79 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  31.37 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  25.81 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.27 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.1 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  25.82 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  28.09 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  27.3 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>