More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1358 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1358  integrase, truncation  100 
 
 		 158 aa  334  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.760246  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  92.2 
 
 		 422 aa  274  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  90 
 
 		 415 aa  268  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  79.86 
 
 		 414 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  83.46 
 
 		 413 aa  240  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  73.13 
 
 		 409 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  73.05 
 
 		 416 aa  223  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  69.57 
 
 		 418 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  66.91 
 
 		 419 aa  214  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  63.95 
 
 		 418 aa  207  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  68.42 
 
 		 415 aa  200  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  65.94 
 
 		 411 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  63.91 
 
 		 418 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  64.12 
 
 		 409 aa  190  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  62.41 
 
 		 416 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  59.86 
 
 		 413 aa  187  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  63.77 
 
 		 412 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  60.56 
 
 		 413 aa  185  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  65.91 
 
 		 411 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  65.35 
 
 		 416 aa  185  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  64.12 
 
 		 417 aa  185  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  65.91 
 
 		 411 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  63.57 
 
 		 411 aa  184  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  58.57 
 
 		 413 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  62.6 
 
 		 395 aa  181  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  62.6 
 
 		 403 aa  180  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  63.41 
 
 		 397 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  63.87 
 
 		 402 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  62.1 
 
 		 398 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  57.55 
 
 		 413 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  56.34 
 
 		 415 aa  174  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  61.43 
 
 		 414 aa  174  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  61.83 
 
 		 408 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  60.48 
 
 		 410 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  60.16 
 
 		 399 aa  167  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  48.55 
 
 		 410 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  60.14 
 
 		 408 aa  148  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  46.81 
 
 		 416 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  44.27 
 
 		 418 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  46.77 
 
 		 402 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  46.46 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  46.46 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  46.46 
 
 		 436 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.86 
 
 		 404 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  45.16 
 
 		 396 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  42.52 
 
 		 413 aa  126  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  44.53 
 
 		 423 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  45.83 
 
 		 387 aa  124  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  47.15 
 
 		 404 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  46.83 
 
 		 403 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  40.94 
 
 		 404 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  40.94 
 
 		 404 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  40.94 
 
 		 404 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  41.94 
 
 		 417 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  41.94 
 
 		 394 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  43.09 
 
 		 397 aa  120  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  41.94 
 
 		 394 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  43.08 
 
 		 410 aa  120  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  41.73 
 
 		 396 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.28 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  44.35 
 
 		 401 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  41.54 
 
 		 290 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  45.6 
 
 		 397 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  41.94 
 
 		 395 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.28 
 
 		 394 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.28 
 
 		 394 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  45.04 
 
 		 412 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  43.33 
 
 		 387 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  42.86 
 
 		 396 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  42.5 
 
 		 394 aa  117  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  43.75 
 
 		 391 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  36.84 
 
 		 402 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  43.33 
 
 		 391 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  45.24 
 
 		 399 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  41.73 
 
 		 429 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  39.06 
 
 		 404 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  37.1 
 
 		 396 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  39.84 
 
 		 404 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  40.15 
 
 		 402 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  38.46 
 
 		 404 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  40.77 
 
 		 394 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  40.5 
 
 		 389 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  42.86 
 
 		 409 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  40.91 
 
 		 417 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  40.62 
 
 		 402 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  38.24 
 
 		 412 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  42.4 
 
 		 398 aa  110  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3652  phage integrase family protein  41.22 
 
 		 387 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  42.74 
 
 		 395 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  42.28 
 
 		 395 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  38.89 
 
 		 402 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  38.97 
 
 		 401 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  39.2 
 
 		 390 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  45.74 
 
 		 407 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 393 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  38.97 
 
 		 418 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  41.98 
 
 		 401 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  37.4 
 
 		 404 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  40.68 
 
 		 391 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  41.61 
 
 		 448 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>