More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2191 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2191  Phage integrase  100 
 
 		 418 aa  854    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  42.82 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  40.1 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  43.28 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  40.1 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  39.85 
 
 		 404 aa  309  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.63 
 
 		 402 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.79 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.79 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  42.48 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  38.85 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  41.04 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  40.05 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  42.82 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  42.68 
 
 		 391 aa  299  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  41.41 
 
 		 396 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  39.35 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  42.79 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.58 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  42.04 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  39.9 
 
 		 409 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.05 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  42.44 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  42.14 
 
 		 410 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  39.95 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  40 
 
 		 417 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  39.85 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  38.64 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  39.85 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  39.14 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  41.46 
 
 		 438 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  39.2 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  41.01 
 
 		 405 aa  285  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  41.67 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  40.39 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  39.45 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  39.63 
 
 		 395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  40.99 
 
 		 404 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  39.21 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  39.21 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  39.21 
 
 		 404 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  39.61 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  40.69 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  41.41 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  41.29 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  42.96 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  38.88 
 
 		 420 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  40.26 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  39.11 
 
 		 411 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  39.56 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  41.04 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  39.16 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  38.86 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  36.48 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  38.57 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  39.1 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  37.68 
 
 		 421 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  41.55 
 
 		 367 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  38.72 
 
 		 378 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  39.45 
 
 		 406 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  38.9 
 
 		 394 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  37.68 
 
 		 412 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  40.44 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  40.55 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  38.19 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  38.06 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  40.59 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  37.31 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  39.8 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  36.23 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  37.18 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  37.93 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  38.05 
 
 		 419 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  41.16 
 
 		 427 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.85 
 
 		 422 aa  252  8.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  37.84 
 
 		 428 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  36.08 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  36.63 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  38 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  38.67 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.95 
 
 		 420 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  35.14 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  38.48 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  36.45 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  39.13 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  35.48 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  36.23 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  35.61 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  37.89 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  38.24 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  35.61 
 
 		 425 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  35.71 
 
 		 421 aa  246  6e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  35.48 
 
 		 420 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  37.97 
 
 		 398 aa  246  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  37.26 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  36.88 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  36.91 
 
 		 421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  36.91 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  36.53 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  36.97 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>