More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3699 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3699  phage integrase  100 
 
 		 116 aa  240  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  87.16 
 
 		 462 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  82.46 
 
 		 404 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  80.7 
 
 		 404 aa  200  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  80.7 
 
 		 404 aa  199  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  79.82 
 
 		 404 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  67.27 
 
 		 421 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  64.66 
 
 		 420 aa  153  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  68.22 
 
 		 427 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  60.91 
 
 		 412 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  64.04 
 
 		 445 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  63.16 
 
 		 403 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  63.39 
 
 		 410 aa  148  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  66.36 
 
 		 400 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  66.06 
 
 		 406 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  63.3 
 
 		 406 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  67.29 
 
 		 411 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  63.64 
 
 		 405 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  63.3 
 
 		 407 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  60.36 
 
 		 403 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  61.61 
 
 		 413 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  62.39 
 
 		 378 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  61.21 
 
 		 419 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  56.14 
 
 		 409 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  59.17 
 
 		 407 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  54.62 
 
 		 433 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  58.72 
 
 		 403 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  56.88 
 
 		 429 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  57.8 
 
 		 428 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  55.26 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  52.17 
 
 		 413 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  55.56 
 
 		 421 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  53.21 
 
 		 413 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  51.35 
 
 		 394 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  50 
 
 		 415 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  47.79 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  50.46 
 
 		 412 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  47.71 
 
 		 403 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  44.95 
 
 		 398 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  50.46 
 
 		 402 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  47.17 
 
 		 417 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  50 
 
 		 402 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  43.93 
 
 		 419 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  42.99 
 
 		 419 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  43.93 
 
 		 449 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  42.06 
 
 		 419 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  45.45 
 
 		 395 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  43.93 
 
 		 419 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  42.06 
 
 		 419 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  43.93 
 
 		 419 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  45.87 
 
 		 399 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  40.19 
 
 		 424 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  40.19 
 
 		 419 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  40.19 
 
 		 423 aa  94.7  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  45.45 
 
 		 405 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  40.91 
 
 		 420 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.99 
 
 		 420 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  39.25 
 
 		 423 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  41.82 
 
 		 397 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  40.19 
 
 		 419 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  41.12 
 
 		 418 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  41.82 
 
 		 421 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  41.59 
 
 		 419 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  41.12 
 
 		 419 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  40.19 
 
 		 419 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  41.12 
 
 		 418 aa  90.1  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  42.06 
 
 		 439 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  42.45 
 
 		 438 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  43.4 
 
 		 396 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.4 
 
 		 394 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  39.25 
 
 		 421 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.4 
 
 		 394 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  41.82 
 
 		 410 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  40.54 
 
 		 402 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  38.18 
 
 		 416 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  44.04 
 
 		 444 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  41.38 
 
 		 402 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  39.25 
 
 		 419 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  45.45 
 
 		 391 aa  87  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  42.59 
 
 		 404 aa  86.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.28 
 
 		 404 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  39.45 
 
 		 404 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  37.84 
 
 		 425 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 420 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  39.45 
 
 		 404 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  37.84 
 
 		 425 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  38.32 
 
 		 411 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1605  phage integrase  40.91 
 
 		 448 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0701164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.61 
 
 		 422 aa  84.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  43.56 
 
 		 396 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  40.35 
 
 		 402 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  37.84 
 
 		 428 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0886  phage integrase  40.91 
 
 		 454 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00972856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  39.45 
 
 		 404 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  36.61 
 
 		 419 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  43.93 
 
 		 404 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  41.35 
 
 		 396 aa  84  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.39 
 
 		 420 aa  84  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  40.95 
 
 		 409 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  41.67 
 
 		 401 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>