197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1048 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1048  phage integrase  100 
 
 		 125 aa  259  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1014  phage integrase  99.2 
 
 		 125 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0982  phage integrase  94.4 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0954  phage integrase  94.4 
 
 		 125 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0845294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  50 
 
 		 403 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  51.67 
 
 		 419 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  54.87 
 
 		 411 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  51.33 
 
 		 398 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  46.61 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  46.9 
 
 		 410 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  53.64 
 
 		 409 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  46.9 
 
 		 390 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  47.01 
 
 		 343 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  46.15 
 
 		 397 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  45.38 
 
 		 420 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  44.54 
 
 		 420 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  49.56 
 
 		 397 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  59.74 
 
 		 436 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  40.16 
 
 		 411 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  46.55 
 
 		 228 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  45.13 
 
 		 406 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 434 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  46.09 
 
 		 399 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  45 
 
 		 408 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  43.22 
 
 		 438 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  42.11 
 
 		 391 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  42.98 
 
 		 391 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  46.96 
 
 		 459 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  43.33 
 
 		 407 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  40.35 
 
 		 404 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  37.72 
 
 		 417 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  45.13 
 
 		 432 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  44.44 
 
 		 400 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  41.23 
 
 		 412 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  37.8 
 
 		 401 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  40 
 
 		 450 aa  87  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  38.81 
 
 		 439 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  42.34 
 
 		 407 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  42.97 
 
 		 410 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  43.22 
 
 		 400 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  43.22 
 
 		 402 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  39.84 
 
 		 429 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  41.96 
 
 		 411 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  40.32 
 
 		 429 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  37.93 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  39.13 
 
 		 421 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  41.49 
 
 		 408 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  40.86 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  42.7 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  35.9 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  35.65 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  37.07 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  37.39 
 
 		 403 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  36 
 
 		 403 aa  67  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  36.51 
 
 		 404 aa  67  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  34.78 
 
 		 412 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  35.9 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  34.78 
 
 		 403 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  30.7 
 
 		 384 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  35.65 
 
 		 406 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  37.07 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  28.07 
 
 		 401 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  33.05 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  35.34 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3699  phage integrase  37.23 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  35.04 
 
 		 404 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  36.84 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  37.39 
 
 		 433 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  32.79 
 
 		 423 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  33.93 
 
 		 412 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  37.93 
 
 		 407 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  39.47 
 
 		 402 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  33.61 
 
 		 405 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  30.58 
 
 		 410 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  33.33 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  35.65 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  31.45 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  32.2 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  32.23 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  37.07 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  32.17 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  32.17 
 
 		 419 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  31.4 
 
 		 411 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  33.33 
 
 		 407 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  31.36 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  36.75 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  34.21 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  34.78 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  33.05 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  36.52 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  32.46 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  36.67 
 
 		 402 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  36.84 
 
 		 399 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 378 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  36.52 
 
 		 418 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  32.48 
 
 		 407 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>