More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3683 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  100 
 
 		 444 aa  911    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  31.22 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  32.54 
 
 		 439 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  31.69 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  30.83 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  30.29 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  30.84 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  36.52 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  30.08 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  29.91 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  33.06 
 
 		 400 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  28.57 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  31.26 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  30.09 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  27.54 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  28.67 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  29.66 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  29.07 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.36 
 
 		 413 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  29.17 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  27.49 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.97 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  26.33 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  34.66 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  26.64 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  27.17 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  28.5 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  28.77 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  28.4 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  27.78 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  28.6 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  26.88 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  28.7 
 
 		 481 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.94 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.61 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  28.02 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  26.91 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  26.9 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  25.43 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  27.23 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  26.1 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  27.25 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  25.94 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.82 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  28.05 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  26.07 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.82 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  26.94 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  36.04 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.59 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  26.94 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  24.43 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  28.64 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  25.57 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  25.72 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  26.45 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  27.07 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  27.47 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 409 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  24.94 
 
 		 401 aa  96.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.64 
 
 		 400 aa  96.3  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  25.4 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.51 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.28 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.79 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  24.5 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  30.84 
 
 		 453 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  26.61 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  26.34 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  24.55 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  26.59 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  26.26 
 
 		 412 aa  93.6  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.2 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  26.15 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  26.25 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  24.32 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  25.58 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  26.37 
 
 		 402 aa  90.5  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  25.94 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  24.15 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  27 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>