More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0672 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0672  phage integrase  100 
 
 		 410 aa  859    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  27.45 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3051  integrase family protein  27.54 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0515706  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00841  integrase  29.22 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1061  phage integrase family protein  26.71 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.69421  normal  0.669577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0792  integrase family protein  27.23 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.637485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3795  integrase family protein  27.12 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000111159  unclonable  0.000000215958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  27.79 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  24.77 
 
 		 461 aa  96.7  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  23.84 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  23.84 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  22.89 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  23.6 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1318  phage integrase  23.63 
 
 		 457 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.398126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  23.37 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  24.88 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  25.34 
 
 		 437 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  22.3 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.3 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  24.34 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  25.45 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  23.73 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 449 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  24.95 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  24.04 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.58 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  23.8 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  23.49 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  22.93 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  22.3 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  23.21 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  23.1 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  22.67 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  22.25 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  25.95 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  24.05 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  23.74 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3484  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  22.86 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  23.46 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5206  phage integrase  25.27 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  22.86 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  23.81 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  24.46 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  22.2 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  22.89 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  23.15 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.82 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  23.25 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  22.87 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  24.32 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23.31 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  21.96 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  22.97 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  22.7 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  22.41 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  20.82 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  24.29 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0368  phage integrase  22.69 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  22.09 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  23.9 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  24.4 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  22.65 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  23.82 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3107  integrase  40.52 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0236409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.25 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  23.15 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  21.88 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  23.52 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.93 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  23.44 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1130  integrase family protein  22.27 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  22.3 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  22.46 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  22.43 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  23.06 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  23.33 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  22.93 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.81 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  24.91 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.88 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  21.41 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.88 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  23.57 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  23.67 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  22.47 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  23.93 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  22.28 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  22.54 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  23.88 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  21.38 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  22.99 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>