More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1277 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  100 
 
 		 454 aa  922    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  38.29 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5756  integrase family protein  41.54 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2501  phage integrase, putative  34.95 
 
 		 469 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  30.63 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  26.98 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0897  integrase family protein  36.06 
 
 		 553 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  27.44 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  26.59 
 
 		 401 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.88 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  28.57 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  28.04 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  26.79 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 393 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.63 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  23.72 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.45 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.37 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  22.52 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.22 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.89 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  25.23 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  25.24 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  25.24 
 
 		 414 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  23.68 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  25.11 
 
 		 418 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  24.53 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  25.46 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  25.39 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  24.53 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  23.65 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  23.93 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  23.93 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  24.3 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.36 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  25.42 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  22.61 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.15 
 
 		 391 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  22.84 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  22.82 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  25.29 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  25.57 
 
 		 422 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 401 aa  93.2  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  24.55 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  21.75 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  21.75 
 
 		 404 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  21.75 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  24.77 
 
 		 398 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  24.62 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.09 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  23.49 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.16 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  24.54 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  25.11 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.94 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 418 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  23.44 
 
 		 423 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  23.58 
 
 		 399 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  23.15 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  23.84 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  23.98 
 
 		 402 aa  89.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  25.49 
 
 		 643 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  23.04 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 400 aa  89  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.34 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  23.08 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  23.28 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.89 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  25.87 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.48 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  24.35 
 
 		 398 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.78 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  23.39 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  22.82 
 
 		 409 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.88 
 
 		 439 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 419 aa  87  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  22.82 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  24.94 
 
 		 618 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  22.66 
 
 		 409 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  22.66 
 
 		 409 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  24.82 
 
 		 601 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  23.57 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1465  phage integrase  23.8 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>