More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2900 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  100 
 
 		 391 aa  788    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  39.7 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  37.32 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  38.18 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  37.84 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  32.67 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 426 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  35.86 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  31.54 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4935  putative phage-like integrase  32.72 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  33.5 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  30.42 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  32.64 
 
 		 450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  31.67 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  33.74 
 
 		 400 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.92 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.25 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.68 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  27.92 
 
 		 427 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  29.11 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  29.18 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.93 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  27.43 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  25.69 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.63 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  29.82 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  29.55 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  29.54 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  29.27 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  29 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  30.67 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.39 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.39 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0388  phage integrase family site specific recombinase  28.81 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.38 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  26.77 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1639  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0427266  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  28.2 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  26.89 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  24.79 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  26.89 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  26.06 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.85 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  27.57 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.87 
 
 		 418 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  27.2 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  26.68 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  26.75 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  26.44 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3013  phage integrase family site specific recombinase  25.12 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.76 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.72 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  24.01 
 
 		 453 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  25.88 
 
 		 427 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000471518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  25 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.53 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.56 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.98 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.05 
 
 		 463 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25.95 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  25.14 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  0.000000698249 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  26.28 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.26 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  24.32 
 
 		 443 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  25.47 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  24.73 
 
 		 402 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  25.5 
 
 		 422 aa  89.7  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  24.35 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  27.16 
 
 		 418 aa  89.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  22.99 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  26.55 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  24.22 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  26.26 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  26.04 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.06 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  25.12 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  25.61 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  25.38 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  24.12 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  27.42 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  26.86 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  26.77 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>