200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1370 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  100 
 
 		 423 aa  882    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  68.16 
 
 		 425 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  28.24 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  28.18 
 
 		 486 aa  182  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  27.25 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.93 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  27.75 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  25.17 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.56 
 
 		 410 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  27.98 
 
 		 413 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  25.3 
 
 		 487 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.09 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  23.61 
 
 		 486 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  24.14 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  24.87 
 
 		 515 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  22.14 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.13 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  22.94 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  21.68 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.97 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  23.78 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  23.27 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.01 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.76 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  22.06 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  21.98 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  22.06 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  22.06 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  24.63 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.82 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  21.11 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.14 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.15 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  19.82 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  22.97 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  30 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.15 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  24.09 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  23.72 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  22.81 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  27.84 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  23.43 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  23.28 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.75 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  27.06 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  33.99 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3189  integrase family protein  22.91 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000247196  hitchhiker  0.000000000920932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28.08 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  22.47 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  23.8 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  25 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  27.5 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.95 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.06 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  20.98 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  20.13 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  20.13 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  22.58 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  26.67 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  20.49 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  21.85 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  24.82 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  26.83 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.67 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4647  integrase family protein  27.57 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  22.9 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.67 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  22.56 
 
 		 361 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  23.17 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  22.08 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  21.59 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  24.18 
 
 		 344 aa  53.5  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  22.61 
 
 		 375 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  21.93 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  26 
 
 		 296 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  21.93 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  24.84 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  23.89 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  23.58 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  26 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  30.63 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  23.78 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.95 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  40.32 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.24 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  29.58 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  23.06 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  29.45 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.79 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>