119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2717 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  100 
 
 
479 aa  982    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  67.61 
 
 
457 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  67.61 
 
 
457 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  63.93 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  61.05 
 
 
472 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  48.17 
 
 
441 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  44.57 
 
 
452 aa  353  5e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  43.6 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  37.47 
 
 
440 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  39.13 
 
 
450 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.08 
 
 
424 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.35 
 
 
417 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.46 
 
 
406 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  26.55 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25.46 
 
 
413 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  23.33 
 
 
403 aa  84  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.11 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  23.97 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  22.62 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.67 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  23.63 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.13 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  21.91 
 
 
420 aa  64.7  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  25.39 
 
 
434 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.47 
 
 
400 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.82 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  22.92 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.16 
 
 
391 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  22.66 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.69 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  21.74 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.19 
 
 
463 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  29.33 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.15 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  23.26 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  23.99 
 
 
417 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.88 
 
 
422 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  26.11 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  29.61 
 
 
351 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  27.37 
 
 
398 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  20.61 
 
 
448 aa  54.3  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  29.87 
 
 
442 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  29.87 
 
 
393 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.63 
 
 
431 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30 
 
 
377 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  24.01 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  24.41 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  23.66 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30 
 
 
351 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  23.89 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.44 
 
 
390 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  22.89 
 
 
396 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  27.43 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.56 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  25.15 
 
 
159 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  28.14 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  28.14 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.04 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  27.27 
 
 
430 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  25 
 
 
172 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.8 
 
 
432 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  26.67 
 
 
385 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  23.01 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  23.77 
 
 
389 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  23.43 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.11 
 
 
378 aa  50.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  23.37 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  24.83 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0993  integrase family protein  22.33 
 
 
320 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00576914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  25.44 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  21.95 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  34.21 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.55 
 
 
416 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  26.03 
 
 
515 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5073  hypothetical protein  35.11 
 
 
159 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  23.06 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  25.66 
 
 
288 aa  48.5  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  28.25 
 
 
371 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.84 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.13 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.03 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  24.01 
 
 
392 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0432  integrase family protein  30.82 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  22.64 
 
 
370 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  23.83 
 
 
251 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.37 
 
 
295 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  24.12 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  24.87 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.44 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.68 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  22.22 
 
 
404 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  27.61 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.54 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.03 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.03 
 
 
376 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  31.45 
 
 
305 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  22.5 
 
 
440 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  20.65 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  25.14 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>