47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3028 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  83.82 
 
 		 487 aa  848    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  100 
 
 		 486 aa  1004    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  25.23 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 425 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.84 
 
 		 486 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.02 
 
 		 406 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  23.61 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  25.85 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.3 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.47 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  23.45 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.68 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.46 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  23.88 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  21.68 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.84 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  24.58 
 
 		 400 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  22.79 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.16 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.16 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  25.41 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.19 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  29.76 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.04 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  24.57 
 
 		 429 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  21.51 
 
 		 366 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  23.53 
 
 		 384 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  31.67 
 
 		 182 aa  47  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  24.87 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  26.92 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  25.21 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  26.37 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  23.18 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  23.42 
 
 		 357 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  22.31 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  21.61 
 
 		 432 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  32.17 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.31 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>