41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2956 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  100 
 
 
487 aa  1005    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  83.82 
 
 
486 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  26.51 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.23 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  25.3 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  24.88 
 
 
417 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.78 
 
 
406 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.09 
 
 
486 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.32 
 
 
410 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.06 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  22.93 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.24 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  22 
 
 
476 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  22.2 
 
 
409 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  23.76 
 
 
441 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.37 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.28 
 
 
159 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  23.5 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.82 
 
 
400 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 
172 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.48 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  26.09 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  29.29 
 
 
420 aa  50.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  25.44 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.29 
 
 
463 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  27.98 
 
 
500 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.84 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  27.1 
 
 
366 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.33 
 
 
387 aa  47  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2339  hypothetical protein  22.38 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.562692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  23.83 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  24.87 
 
 
182 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  23.62 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2182  hypothetical protein  22.38 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  24.41 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  24.41 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  23.54 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.27 
 
 
448 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  24.05 
 
 
357 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7388  putative integrase  21.78 
 
 
432 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  30.43 
 
 
402 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>