142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3461 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  100 
 
 		 435 aa  885    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  55.43 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  43.83 
 
 		 457 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  43.83 
 
 		 457 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  44.04 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  43.6 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  43.46 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  42.79 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  42.13 
 
 		 450 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  35.94 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.99 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.78 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.53 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.83 
 
 		 387 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  22.14 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.83 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  19.82 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  22.93 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  20.67 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  22.2 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  23.34 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  22.47 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  25.54 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  25.29 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.26 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.32 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  25.06 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  23.77 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  29.09 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  28.73 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  23.31 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  22.65 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.99 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  29.38 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.23 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  22.1 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.79 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.88 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.61 
 
 		 270 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  25.49 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.87 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.07 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 367 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  26.97 
 
 		 172 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  25.71 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 159 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  31.08 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.72 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  21.56 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  29.46 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  25.99 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  23.04 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  22.25 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.95 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  26.47 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.67 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  25.6 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  23.44 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 376 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  29.22 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 356 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.65 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.45 
 
 		 452 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  29.61 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  25.95 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.05 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.13 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  24.64 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  24.92 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  27.03 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.44 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.17 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  27.33 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0292  phage integrase family site specific recombinase  26.72 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  23.12 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  22.37 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  25.98 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  22.54 
 
 		 376 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  22.37 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0544  phage integrase family site specific recombinase  25.17 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.400058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  23.08 
 
 		 306 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  27.94 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  23.77 
 
 		 400 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.49 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  20.7 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>