More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2340 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  43.41 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0330  integrase family protein  39.89 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  40 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0178  phage integrase family protein  37.19 
 
 		 210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4683  integrase family protein  34.85 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2725  integrase family protein  35.71 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  33.72 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.24 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0195  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  34.84 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  32.21 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 		 346 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  34.69 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  31.33 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  32.65 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  27.16 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.72 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  29.41 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  26.5 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0019  putative integrase/resolvase  32.12 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.41 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  34.46 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  32.93 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.11 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  22.62 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.43 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.43 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.6 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  28.67 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  28.67 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  32.47 
 
 		 362 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.92 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.26 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  29.93 
 
 		 313 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.91 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  30.87 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  28.06 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  28.66 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  27.75 
 
 		 325 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25.83 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 344 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  24.72 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.01 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  26.19 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  28.87 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.31 
 
 		 298 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  27.81 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.92 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  23.46 
 
 		 423 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.17 
 
 		 308 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 		 328 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 309 aa  52.8  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  27.57 
 
 		 337 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.43 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.92 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 298 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  27.11 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 311 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.71 
 
 		 295 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 298 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.18 
 
 		 312 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3300  tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 299 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  28.31 
 
 		 289 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 319 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>