36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0596 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  100 
 
 
515 aa  1053    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  69.09 
 
 
442 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  58.81 
 
 
505 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  58.81 
 
 
505 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  50.26 
 
 
255 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  27.5 
 
 
413 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  26.46 
 
 
409 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  26.2 
 
 
424 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  24.21 
 
 
417 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  27.54 
 
 
375 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.35 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.66 
 
 
486 aa  87  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  24.87 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  23.83 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.42 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0569  hypothetical protein  45.24 
 
 
114 aa  70.1  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.3 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  26.77 
 
 
410 aa  64.3  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.96 
 
 
412 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  23.53 
 
 
420 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  24.02 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  23.4 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  22.19 
 
 
404 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  23.93 
 
 
405 aa  53.9  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  25.91 
 
 
435 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  24.25 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  21.81 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  24.77 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.23 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  25.6 
 
 
452 aa  47  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.09 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.43 
 
 
432 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  24.78 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  23.08 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  22.55 
 
 
384 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.19 
 
 
411 aa  43.9  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>