More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0550 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  83.33 
 
 
427 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  100 
 
 
413 aa  850    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  43.51 
 
 
403 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  41.45 
 
 
405 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  39.15 
 
 
404 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  38 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  37.05 
 
 
404 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.35 
 
 
415 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  37.24 
 
 
422 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  38.77 
 
 
420 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  36.85 
 
 
439 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  36.83 
 
 
422 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  36.83 
 
 
419 aa  229  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  34.74 
 
 
420 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  35.76 
 
 
425 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  37.15 
 
 
418 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  34.64 
 
 
419 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  37.12 
 
 
293 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  31.34 
 
 
515 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  27.34 
 
 
408 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  27.05 
 
 
414 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  27.05 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  28.98 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  28.25 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  26.32 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  28.31 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.57 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  28.37 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  29.17 
 
 
396 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  27.75 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  26.87 
 
 
415 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.39 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  28.68 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  26.65 
 
 
410 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.89 
 
 
394 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  27.06 
 
 
402 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  27.96 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.89 
 
 
394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  27.89 
 
 
412 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  27.75 
 
 
417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  26.8 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  25.83 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  27.41 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  28.4 
 
 
389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  27.2 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  27.7 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  25.67 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  26.79 
 
 
404 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  27 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1967  integrase family protein  26.07 
 
 
429 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.0364461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  29.18 
 
 
415 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  26.97 
 
 
397 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  26.28 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  26.49 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  26.6 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  26.84 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  27.11 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  24.63 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  26.01 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  26.32 
 
 
404 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  26.32 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 
394 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  27.84 
 
 
413 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.88 
 
 
402 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  26.13 
 
 
416 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  28.64 
 
 
410 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  26.76 
 
 
446 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  27.3 
 
 
395 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  27.82 
 
 
409 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  30.66 
 
 
455 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  26.77 
 
 
418 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  25.32 
 
 
414 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  25.32 
 
 
395 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  26.78 
 
 
422 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  27.89 
 
 
413 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  26.59 
 
 
402 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  25.12 
 
 
403 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  26.76 
 
 
412 aa  106  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  27.18 
 
 
397 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  26.07 
 
 
409 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  27.37 
 
 
416 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  27.44 
 
 
408 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  26.58 
 
 
414 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  26.51 
 
 
413 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  26.58 
 
 
409 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  26.38 
 
 
404 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  26.58 
 
 
409 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  25.94 
 
 
411 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  25.99 
 
 
401 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  25.94 
 
 
411 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.93 
 
 
400 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  24.55 
 
 
390 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.25 
 
 
426 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  26.11 
 
 
387 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  25.71 
 
 
411 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  28.61 
 
 
367 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  24.32 
 
 
406 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>